Chráněné území Tůň u trati bylo vyhlášeno v roce 1986 podle stavebního zákona a nachází se při okraji obce Štěpánovice u železničního nádraží při levém břehu Svratky v nadmořské výšce 260 m n. m. Je tvořeno obdélníkovou uměle vyhloubenou tůní. V posledních letech byla vyhloubena další menší tůňka.
Chráněné území Tůň u trati chrání rozmnožovací lokalitu zvláště chráněných druhů obojživelníků, především kriticky ohroženého čolka velkého (Triturus cristatus).
Tůň u Štěpánovického nádraží patří k několika málo lokalitám na okrese, kde se dodnes vyskytuje kriticky ohrožený čolek velký (Triturus cristatus). Z dalších druhů obojživelníků se zde dodnes rozmnožují početnější populace čolka obecného (Triturus vulgaris) a skokana štíhlého (Rana dalmatina). V menších počtech se rozmnožuje i skokan hnědý (Rana temporaria) a ropucha obecná (Bufo bufo). V minulosti byla zjištěna také rosnička zelená (Hyla arborea).
V tůni se můžeme setkat i se dvěma druhy našich užovek, které sem čas od času přicházejí na lov z přilehlé řeky Svratky, po které přes obec pravidelně migrují. Jde o běžnou užovku obecnou (Natrix natrix), ale také ryze vodní a daleko vzácnější užovku podplamatou (Natrix tessellata).
Z hlediska zájmů ochrany přírody (především s ohledem na populaci čolka velkého) je žádoucí vytvořit v návaznosti na stávající tůně rozsáhlý mokřadní komplex.